Pour mettre en œuvre les actions portées par le CLS, une vingtaine d'acteurs composent un comité de pilotage dédié. Parmi eux, aux côtés de Rennes Métropole, de la Ville de Rennes et de l'ARS : la Caisse d'Allocations familiales (CAF), la Caisse Primaire d'Assurance Maladie (CPAM) d'Ille-et-Vilaine, la Préfecture, le Centre Hospitalier Universitaire de Rennes (CHU), le Centre Hospitalier Guillaume Régnier (CHGR), l'Éducation Nationale, le Département d'Ille-et-Vilaine et la Région Bretagne, et encore les représentants d'usagers : France Assos Santé, Maison Associative de la Santé.